GATK HaplotypeCaller SNP Calling 自动化流程
使用GATK进行SNPCallling的自动化流程。基于GATK3.3以上版本的HaplotypeCaller标准流程进行,测试脚本以sra文件为最初输入,将读取文件见内的所有sra文件(视为同一个样本的数据),进行SNPCalling产生GVCF,然后用户可自行进行jointCall
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