ngs_scripts:我经常使用的脚本源码

上传：exclaim_52711 浏览： 19 推荐： 0 文件：ZIP 大小：13KB 上传时间：2021-04-01 04:46:25 版权申诉

ngs_scripts 我经常使用的ngs脚本的存储库。脚本清单 align_RAD_2019.sh =对齐R1和R2 fastq文件中的RAD数据(markdup,fixmate) align_ind_fa_2019.sh =单个fastq文件中数据的基本对齐 Barcodes_pst1.csv =用逗号分隔的Pst1条码列表 Barcodes_sbf1.csv-Sbf1条码的逗号分隔列表 BarcodeSplitList3Files.pl = Perl脚本,用于根据给定的条形码拆分通道 BCsplitBestRadPE2.pl = perl脚本,用于通过内嵌条形码按Kong划分每个泳道。注意:现在需要在行中提供条形码-确保条形码与RE相匹配 BUSCOv?.sh =运行BUSCO版本x的脚本 RUN_alignment_RAD.slurm =要提交以对齐RAD PE数据的Slurm