nim dna seq:Nim软件包用于处理核苷酸序列数据 源码

bio_seq 一个用于将核苷酸编码为IUPAC模糊度代码以及写入和读取FASTA文件的库。 基于的核苷酸的8位无符号整数表示形式 对齐解析 对于解析对齐,要求所有FASTA条目都具有相同的长度,否则将引发错误。 解析对齐字符串 import bio_seq let s = ">header1 \n ACTG \n >header2 \n >CTUG" let r = parseFastaAlignmentString (s) 解析对齐文件 import nim_seq let f = parseFastaAlignmentFile ( "file.fasta" ) 目前尚不支持写入FASTA文件,但将在接下来的几周内添加 核苷酸转化 将字符转换为核苷酸 import nim_seq let nuc = 'A' . toNucleotide 也可以创建具有类型构造器的核苷酸,但是不建