FlyMet:用于果蝇组织的多组学Web应用程序 源码

WebOmics WebOmics是集成和探索不同类型的生物组学数据的仪表板。 使用此工具,您可以将转录组学,蛋白质组学和代谢组学数据映射到代谢途径上。 WebOmics使用作为知识库来跨不同的组学映射实体。 还包括对途径进行排名并突出有趣的联系的方法。 要求: 后端使用Django 2.0 / Python和rpy。 本地Reactome安装。 用于分析和运行笔记本的常用科学python堆栈(Numpy / Scipy / Pandas)(可选)。 如何安装? 以下是使WebOmics在Ubuntu 18.04上运行的说明。 1.安装Java 8 Neo4j特别需要安装Java 8。 如果您没有安装Java,则可以使用以下命令进行安装: $ sudo apt install openjdk-8-jdk 否则,请验证您是否已安装Java 8: $ java -versi