Python下使用Atom库创建原子结构模型示例代码及技术解答

作者:佚名 上传时间:2023-12-10 运行软件:Python 3.8 软件版本:Atom库版本 0.4.0 版权申诉

Atom库是Python中用于创建和操作原子结构的工具,可用于模拟原子、分子和晶体结构。它提供了一系列功能,包括原子、键和晶胞的定义、结构可视化和计算等。本示例将展示如何使用Atom库创建简单的原子结构模型,并对代码进行详细解释。

from atom import Atom, Structure

# 创建一个碳原子
carbon = Atom('C', position=[0, 0, 0])

# 创建一个氧原子
oxygen = Atom('O', position=[1, 1, 1])

# 创建一个结构并将碳、氧原子添加到结构中
structure = Structure()
structure.append(carbon)
structure.append(oxygen)

# 打印结构信息
print("结构中的原子数:", len(structure.atoms))
print("碳原子坐标:", structure.atoms[0].position)
print("氧原子坐标:", structure.atoms[1].position)

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