scRNA工具:用于分析单细胞RNA序列数据的软件表 源码

scde用于分析单细胞RNA序列数据的R包源码

SCDE概述 scde程序包实现了一组用于分析单细胞RNA-seq数据的统计方法。 scde适合用于单细胞RNA-seq测量的单个误差模型。 然后可以将这些模型用于评估细胞组之间的差异表达以及其他类型

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2021-02-07 15:12

scRNA.seq.course单细胞RNA seq数据过程的分析源码

关于课程 如今,可以使用高通量测序(scRNA-seq)从单个细胞获得全基因组转录组数据。 scRNA-seq的主要优点是细胞分辨率和全基因组范围使解决其他方法难以解决的问题成为可能,例如批量RNA-

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2021-02-09 15:02

scmap单细胞RNA seq数据无监督投影的工具源码

scmap:单细胞RNA-seq数据无监督投影的工具

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2021-02-18 01:56

Seurat用于正常肿瘤DNA和RNA数据的序列分析工具开源

这不再是SEURAT的家。 请转到https://sites.google.com/site/seuratsomatic/-Seurat是一种序列分析程序,用于配对肿瘤,正常基因​​组和转录组数据中的

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2021-04-29 09:18

rnasa用于RNA序列样品的基因表达分析仪源码

纳萨 用于RNA序列样品的基因表达分析仪 安装 $ pip install -U https://github.com/dceoy/rnasa/archive/main.tar.gz 相关命令: pi

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2021-05-02 23:46

single cell pseudotime单细胞RNA序列数据中估计pseudotime的算法综述.zip

single-cell-pseudotime, 单细胞RNA序列数据中估计pseudotime的算法综述 单单元rna序列估计算法单细胞，很多算法。这个页面的目标是编录基于它的基因表达水平的pseud

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2020-07-19 22:02

真棒单细胞社区管理的单细胞软件包和数据资源列表包括RNA seqATAC seq等源码

真棒单细胞:社区管理的单细胞软件包和数据资源列表,包括RNA-seq,ATAC-seq等

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2021-02-07 22:41

scShapes用于建模和识别单细胞RNA测序数据中差异分布的统计框架源码

scShapes 我们提出了一种新的统计框架,用于通过使用广义线性模型(GLM)对基因表达读取计数进行建模,从而确定治疗条件之间单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据中的差异分布。 我们使用对数链

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2021-03-11 11:24

pagoda2R包用于分析和交互式探索大规模单细胞RNA seq数据集源码

宝塔2 pagoda2:大数据集的快速处理和交互式分析 Pagoda2是R包,用于分析和交互式探索大型单细胞RNA-SEQ的数据集。 这些方法经过优化,可快速处理既大又稀疏的现代scRNAseq数据集

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2021-05-12 09:18

liger R软件包用于集成和分析多个单细胞数据集源码

liger:R软件包,用于集成和分析多个单细胞数据集

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2021-02-22 08:34

单细胞分析源码

单细胞分析

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2021-02-23 12:07

scNPF网络传播和网络融合辅助的集成框架用于单细胞RNA seq数据的预处理源码

scNPF R软件包 网络传播和网络融合辅助的整合框架,用于单细胞RNA-seq数据的预处理 关于 scNPF是一个R软件包,用于通过利用给定数据中固有的上下文特定拓扑和先验基因-基因相互作用网络的网

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2021-04-01 06:49

TranscriptomeAnalysisPipeline_DaphniaUVTolerance用于分析短RNA序列读数的Bash shell脚本源码

转录组分析管道_水蚤紫外线耐受性 用于分析水蚤紫外线耐受性处理的短配对末端RNA序列读数的脚本的资料库。 RNA序列分析管道-基因组引导组装 运行脚本 需要使用InputData目录中的inputPa

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2021-02-21 07:04

2021March Advanced Topics in Single Cell RNA Seq VDJ深入研究具有单细胞RNA Seq数据的VDJ分析

研讨会的所有文档最好从github.io页面上查看 单细胞RNA序列分析中的高级主题:VDJ 2021年3月24日,上午9点至下午5:00在线学习 联系人-加州大学戴维斯分校生物信息学核心, ucda

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2021-02-21 23:53

trisicell可扩展的肿瘤系统发育重建和单细胞数据scRNA或scDNA的验证源码

Trisicell-可扩展的肿瘤系统发育重建和单细胞数据验证 Trisicell(三PLE-工具包SI ngle-细胞瘤系统发育),发音为“三轮车”,是可扩展的肿瘤系统发育重建和评估从scRNAseq

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2021-04-26 12:11