scde:用于分析单细胞RNA序列数据的R包 源码

SCDE概述 scde程序包实现了一组用于分析单细胞RNA-seq数据的统计方法。 scde适合用于单细胞RNA-seq测量的单个误差模型。 然后可以将这些模型用于评估细胞组之间的差异表达以及其他类型的分析。 scde软件包还包含pagoda框架,该pagoda框架应用途径和基因集过度分散分析来识别单细胞之间转录异质性的各个方面。 以下出版物详细介绍了差异表达分析的总体方法: 在以下出版物中详细介绍了途径和基因组过度分散分析的总体方法: 有关其他安装信息,教程等,请访问 样品分析和图像 单细胞错误建模 scde使用源自单细胞RNA-seq数据的计数scde拟合单细胞的个体误差模型,