TrAEL seq:TrAEL seq手稿使用的软件集合 源码

特雷尔序列 TrAEL-seq的脚本和信息的集合。 2020年7月21日最新更新 TrAEL-seq预处理(UMI和Poly-T处理) 原始TrAEL-seq FastQ读取应具有以下结构: barcode (UMI) (8bp) // PolyT // Insert 步骤1: 脚本TrAELseq_preprocessing.py删除了读取的前TrAELseq_preprocessing.py (UMI),并将序列添加到readID的末尾(用冒号分隔,例如:UMISEQUENCE )。 质量信息将被丢弃。 readID中的空白用_代替,以在映射后保留UMI