ATAC Seq 管道 源码

ATAC-Seq-管道 要求 此项目需要R版本> = 4.0.0。 使用initialization.sh脚本将正确的R版本自动安装在新的conda环境(ATAC)中。 initialize.sh脚本包括自动安装,可防止与R中的程序包依赖项发生冲突。如果您希望设置自己的环境,则必须修改initialize.sh并为“ Biostrings”,“ BCRANK”和“ seqinr”。 该GitHub管道包括一个可选分支,用于基于轨道的染色质可访问性可视化。 要使用此命令,您将必须在由initialize.sh创建的“ ATAC”环境中安装以下依赖项: Python> = 3.6 numpy