FEAST:scRNA seq中的特征选择 源码

特色:用于scRNA-seq聚类的功能选择 FEAST是一个框架,用于对特征进行排名并选择优化的特征集作为scRNA-seq聚类的输入。 FEAST管道包括三个步骤:( A )。 执行初始聚类。 ( B )。 估计特征的重要性。 ( C )。 验证功能集。 请通过vignette("FEAST")查找详细参考。 Kenong Su 解释了所有版权。 任何与FEAST相关的问题都应发布到GitHub Issue部分的 。 本教程介绍了FEAST的基本功能。 请使用小插图(“ FEAST”)查看更详细的包装小插图。 值得注意的是,可能需要预安装依赖的R软件包,例如SingleCellExperiment,SummarizedExperiment,doParallel,SC3和mclust。 1.软件安装 library(devtools) install_github("suke18/FEA