scRNA seq_Project 源码

scRNA Seq Variation Pipeline源码

该项目的目标是建立一个管道,以重新映射,聚类和量化Goodyer等人的scRNA-Seq数据。 以鉴定在小鼠心脏细胞簇内具有高表达差异的基因。

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2021-04-17 21:58

ScRNA Seq D3E源码

ScRNA-Seq-D3E 这是R中D3E软件包的实现。该软件包可用于分析scRNA-seq数据。 您可以参考以下参考文献“ M. Delmans和M. Hemberg,“离散分布差异表达(d 3 e

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2021-04-29 10:43

scRNA FeatureSelection使用python和R进行scRNA seq分析的几种特征选择方法源码

scRNA特征选择 评价几种基因选择方法 整合基因选择 程序结构 utils- # functions about data processing and several feature select

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2021-04-26 04:25

scRNA.seq.datasets我们小组使用的公共scRNA Seq数据集的集合源码

scRNA.seq.datasets:我们小组使用的公共scRNA-Seq数据集的集合

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2021-02-01 22:41

FEAST scRNA seq中的特征选择源码

特色:用于scRNA-seq聚类的功能选择 FEAST是一个框架,用于对特征进行排名并选择优化的特征集作为scRNA-seq聚类的输入。 FEAST管道包括三个步骤:( A )。 执行初始聚类。 (

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2021-04-22 04:31

scrna kulkarni巨噬细胞与Kulkarni实验室合作分析小鼠scRNA seq巨噬细胞源码

库尔卡尼实验室的scRNA-seq巨噬细胞项目 该存储库包含用于分析由Kulkarni实验室生成的scRNA-seq巨噬细胞数据的代码和分析。 s 斯蒂芬妮·希克斯(Stephanie Hicks)(

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2021-02-22 21:29

scRNA seq SARS CoV2Viremia main.zip源码

scRNA-seq-SARS-CoV2-病毒血症 该存储库包含Rosin等人的分析脚本。 2020年(审查中)。 概括 抽象的 在2019年末,新型冠状病毒(SARS-CoV-2)出现了,此后引起了全

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2021-02-22 12:52

scrattch.vis scrattch的scRNA seq数据可视化源码

scrattch.vis:scrattch的scRNA-seq数据可视化

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2021-02-07 11:06

RSoptSC scRNA seq数据的细胞间通信和谱系推断源码

RSoptSC 更新 演示SoptSC 阅读的SoptSC文章 SoptSC也可作为一个MATLAB包 安装 install.packages( " devtools " ) li

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2021-04-17 21:58

scRNA.seq.course单细胞RNA seq数据过程的分析源码

关于课程 如今,可以使用高通量测序(scRNA-seq)从单个细胞获得全基因组转录组数据。 scRNA-seq的主要优点是细胞分辨率和全基因组范围使解决其他方法难以解决的问题成为可能,例如批量RNA-

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2021-02-09 15:02

scRNA工具用于分析单细胞RNA序列数据的软件表源码

scRNA工具:用于分析单细胞RNA序列数据的软件表

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2021-02-06 14:23

MLtiplet使用多基因组分析进行scRNA seq doubletpleplet检测源码

MLtiplet 使用多基因组分析进行scRNA-seq双峰/多峰检测

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2021-04-26 08:04

scIdx使用Alevin创建诱饵识别索引以进行scRNA seq定量源码

单细胞 此回购包含了一些代码来构建与scRNA-SEQ数据的量化诱饵感知指数。 conda正在安装软件,有关确切的软件版本,请参见。 创建一个Alevin指数 基于Gencode注释(vM25,小鼠)

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2021-04-26 08:04

CytoSPACE scRNA seq数据到空间转录组学数据的最佳映射源码

CytoSPACE:scRNA-seq数据到空间转录组学数据的最佳映射 CytoSPACE是一种新颖的计算策略,用于在空间转录组(ST)测量可能包含多个细胞的贡献的情况下,将单细胞转录组分配给原位空间

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2021-05-11 04:06

ChronicARTNeg_Proj用于通过Seurat软件包处理scRNA Seq数据的设置源码

慢性ARTNeg_Proj Customize_setting_Seurat.txt文件包含详细的设置信息,我们使用这些信息通过Seurat处理scRNA-Seq数据

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2021-02-18 01:56