scRNA seq SARS CoV2 Viremia main.zip 源码

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scRNA-seq-SARS-CoV2-病毒血症该存储库包含Rosin等人的分析脚本。 2020年(审查中)。概括抽象的在2019年末,新型冠状病毒(SARS-CoV-2)出现了,此后引起了全球大流行。了解COVID-19疾病的发病机制对于指导治疗方法的发展和感染患者的治疗很有必要。使用从SARS-CoV-2患者身上抽取的血液的scRNAseq,我们询问SARS-CoV-2是否可以利用免疫细胞作为“特洛伊木马”来传播和访问多个器官系统。我们的数据表明,循环细胞没有被SARS-CoV-2主动感染,并且似乎不是病毒传播的来源。数据单细胞RNA-Seq NCBI GEO:

SARS CoV2源码

SARS-CoV-2 手稿分析先决条件 MacOS / Windows / Linux R(3.5.1版) 安装R [典型时间= 5-10分钟] 打开互联网浏览器,然后访问。单击页面中间“入门”

2021-04-22 00:28

scRNA Seq Variation Pipeline源码

该项目的目标是建立一个管道,以重新映射,聚类和量化Goodyer等人的scRNA-Seq数据。以鉴定在小鼠心脏细胞簇内具有高表达差异的基因。

2021-04-17 21:58

scRNA seq_Project源码

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2021-05-11 04:05

ScRNA Seq D3E源码

ScRNA-Seq-D3E 这是R中D3E软件包的实现。该软件包可用于分析scRNA-seq数据。您可以参考以下参考文献“ M. Delmans和M. Hemberg,“离散分布差异表达(d 3 e

2021-04-29 10:43

scRNA.seq.datasets我们小组使用的公共scRNA Seq数据集的集合源码

scRNA.seq.datasets:我们小组使用的公共scRNA-Seq数据集的集合

2021-02-01 22:41

电晕逆向工程SARS CoV2源码

对冠状病毒(SARS-CoV-2)进行反向工程从这里开始: :thought_balloon: 背景该项目运用来理解病毒。此处的目的仅仅是从基本原理理解病毒。生物学与软件从根本上说,生物系统

2021-02-01 22:19

SARS CoV2查询有关SARS CoV2病毒和大流行的Wikidata查询源码

关于SARS-CoV-2病毒和大流行的Wikidata查询该电子书旨在查看Wikidata中有关病毒和大流行的哪些信息。我希望其他人觉得它有用。如果您喜欢这个项目,请对其加注星标。如果您想贡献

2021-02-01 02:39

FEAST scRNA seq中的特征选择源码

特色:用于scRNA-seq聚类的功能选择 FEAST是一个框架,用于对特征进行排名并选择优化的特征集作为scRNA-seq聚类的输入。 FEAST管道包括三个步骤:( A )。执行初始聚类。 (

2021-04-22 04:31

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从加利福尼亚大学戴维斯分校医学中心收集的环境样品中分析MinION SARS-CoV-2序列数据该github存储库包含来自以下手稿的代码(和数据链接):“从UC Davis收集的医院表面样本进行的

2021-03-25 16:13

scRNA.seq.course单细胞RNA seq数据过程的分析源码

关于课程如今,可以使用高通量测序(scRNA-seq)从单个细胞获得全基因组转录组数据。 scRNA-seq的主要优点是细胞分辨率和全基因组范围使解决其他方法难以解决的问题成为可能,例如批量RNA-

2021-02-09 15:02

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scRNA特征选择评价几种基因选择方法整合基因选择程序结构 utils- # functions about data processing and several feature select

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库尔卡尼实验室的scRNA-seq巨噬细胞项目该存储库包含用于分析由Kulkarni实验室生成的scRNA-seq巨噬细胞数据的代码和分析。 s 斯蒂芬妮·希克斯(Stephanie Hicks)(

2021-02-22 21:29

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2021-02-07 11:06

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