MLtiplet:使用多基因组分析进行scRNA seq doubletpleplet检测 源码

scRNA FeatureSelection使用python和R进行scRNA seq分析的几种特征选择方法源码

scRNA特征选择 评价几种基因选择方法 整合基因选择 程序结构 utils- # functions about data processing and several feature select

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2021-04-26 04:25

scRNA Seq Variation Pipeline源码

该项目的目标是建立一个管道,以重新映射,聚类和量化Goodyer等人的scRNA-Seq数据。 以鉴定在小鼠心脏细胞簇内具有高表达差异的基因。

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2021-04-17 21:58

scRNA seq_Project源码

scRNA-seq_Project

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2021-05-11 04:05

scRNA.seq.datasets我们小组使用的公共scRNA Seq数据集的集合源码

scRNA.seq.datasets:我们小组使用的公共scRNA-Seq数据集的集合

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2021-02-01 22:41

scIdx使用Alevin创建诱饵识别索引以进行scRNA seq定量源码

单细胞 此回购包含了一些代码来构建与scRNA-SEQ数据的量化诱饵感知指数。 conda正在安装软件,有关确切的软件版本,请参见。 创建一个Alevin指数 基于Gencode注释(vM25,小鼠)

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2021-04-26 08:04

scRNA.seq.course单细胞RNA seq数据过程的分析源码

关于课程 如今,可以使用高通量测序(scRNA-seq)从单个细胞获得全基因组转录组数据。 scRNA-seq的主要优点是细胞分辨率和全基因组范围使解决其他方法难以解决的问题成为可能,例如批量RNA-

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2021-02-09 15:02

ScRNA Seq D3E源码

ScRNA-Seq-D3E 这是R中D3E软件包的实现。该软件包可用于分析scRNA-seq数据。 您可以参考以下参考文献“ M. Delmans和M. Hemberg,“离散分布差异表达(d 3 e

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2021-04-29 10:43

FEAST scRNA seq中的特征选择源码

特色:用于scRNA-seq聚类的功能选择 FEAST是一个框架,用于对特征进行排名并选择优化的特征集作为scRNA-seq聚类的输入。 FEAST管道包括三个步骤:( A )。 执行初始聚类。 (

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2021-04-22 04:31

scrna kulkarni巨噬细胞与Kulkarni实验室合作分析小鼠scRNA seq巨噬细胞源码

库尔卡尼实验室的scRNA-seq巨噬细胞项目 该存储库包含用于分析由Kulkarni实验室生成的scRNA-seq巨噬细胞数据的代码和分析。 s 斯蒂芬妮·希克斯(Stephanie Hicks)(

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2021-02-22 21:29

repairSStuBs尝试使用代码更改检测SStuB并使用seq2seq模型进行修复源码

使用代码更改检测简单的愚蠢错误(SStuB),并使用seq2seq模型进行修复 一些代码可与,该是对一个线性Java错误的简单修复的集合。 资料库描述 utils : 该软件包包含一些实用程序模块,用

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2021-04-18 00:04

CytoSPACE scRNA seq数据到空间转录组学数据的最佳映射源码

CytoSPACE:scRNA-seq数据到空间转录组学数据的最佳映射 CytoSPACE是一种新颖的计算策略,用于在空间转录组(ST)测量可能包含多个细胞的贡献的情况下,将单细胞转录组分配给原位空间

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2021-05-11 04:06

scRNA seq SARS CoV2Viremia main.zip源码

scRNA-seq-SARS-CoV2-病毒血症 该存储库包含Rosin等人的分析脚本。 2020年(审查中)。 概括 抽象的 在2019年末,新型冠状病毒(SARS-CoV-2)出现了,此后引起了全

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2021-02-22 12:52

dca深度计数自动编码器可对scRNA seq数据进行消噪源码

深度计数自动编码器可对scRNA-seq数据进行消噪 深度计数自动编码器网络使用具有零膨胀负二项式(ZINB)损失功能的深度自动编码器,通过考虑计数结构,数据的过度分散的性质和稀疏性来对scRNA-s

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2021-04-07 06:55

tf seq2seq使用TensorFlow进行序列到序列学习源码

TF-seq2seq 使用TensorFlow进行序列到序列(seq2seq)学习。 核心构建块是RNN编码器-解码器体系结构和注意机制。 该软件包主要使用最新的(1.2)tf.contrib.seq

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2021-02-17 12:04

seq2seq.pytorch使用PyTorch进行序列到序列学习源码

PyTorch中的Seq2Seq 这是用于在训练序列到序列模型的完整套件。 它由几个模型和代码组成,可以训练和推断使用它们。 使用此代码,您可以训练: 神经机器翻译(NMT)模型 语言模型 图像到字幕

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2021-04-08 06:06